ソウルの公立サンドゥル小学校。新学年始業の日、小学校最後の１年を迎えて気合い十分で学校に向かったハナ（キム・ヒャンギ）は、お調子者のドング（チョン・ボグン）やお嬢様育ちのナリ（イ・ヨンユ）、学年トップのソヒョン（キム・セロン）らと同じ6年3組に。担任への期待に湧く生徒たちだったが、彼らの前に現れたのは、以前の学校で“魔女”と呼ばれていた冷酷な教師、マ・ヨジン（コ・ヒョンジョン）だった！
始業日早々、マ先生は小テストを行い、成績下位の２人を学級委員に任じ、クラスの雑用をさせるという「成績差別」をとる。トラブルでまともに答えを書けなかったハナは、ビリのドングと学級委員をするはめに。子供たちの話に憤慨する親たちだったが、マ先生と面談した途端、先生の信者になってしまう始末。一方で、複雑な家庭事情のドングや、クラスでのけ者にされているボミ（ソ・シネ）など、生徒たちは各々に悩みを抱えていた。そんな生徒たちの弱み容赦なくを追い込んでいくマ先生。
それに抵抗し、反旗を翻す生徒たちだが……。
6年3組の絶対権力者、“魔女”マ先生は何者なのか？